本中心之中文全名原為「財團法人國家實驗研究院國家實驗動物中心」，經國科會核准，變更名稱為「財團法人國家實驗研究院國家生物模式中心」。

本中心英文全名原為National Applied Research Laboratories National Laboratory Animal Center，亦同步變更為National Institutes of Applied Research National Center for Biomodels。

更名後，本中心之中文簡稱變更為「生物模式中心」，英文簡稱變更為「NCB」。